超大陸の一つ。プレートテクトニクス理論によると今からおよそ6億年前にロディニア大陸から分裂して誕生したと考えられている。その位置は概ね南半球で、現在の大西洋付近である。
ゴンドワナ大陸は、現在のアフリカ大陸、南アメリカ大陸、オーストラリア大陸、南極大陸とインドを含んでいた。
この大陸の頃に原生代は終わり古生代のカンブリア紀が訪れ、この時代以降に生物の大進化が始まった。
そしてゴンドワナ大陸は北上し、約3億年前には赤道付近にあったローラシア大陸と衝突し、これがやがてパンゲア大陸の一部となる。中生代となりジュラ紀後期の1億8000万年前になるとパンゲア大陸は分裂を始め、ゴンドワナ大陸は南に、ローラシア大陸は北へと再び分裂した。
分裂が始まって暫く後のおよそ1億5000万年前(ジュラ紀後期)になると、赤道から南極にかけて存在する大陸となり、北半球にはローラシア大陸となった。これにより大陸内部の乾燥化が軽減され、世界全域で湿潤な亜熱帯気候となった。またこれにより陸上の生態系も南北で交流が絶え、生物は二つの大陸でそれぞれ独自の多様化を遂げることになる。
約1億年前の白亜紀頃に、南アメリカ大陸、アフリカ大陸、南極大陸、オーストラリア大陸と、インドやマダガスカルなどが別れた。インドはおよそ5000万年前にユーラシアと衝突し、現在のような位置となった。