ペストを引き起こすグラム陰性の通性嫌気性桿菌。腸内細菌科エルシニア属に属し、BSL-3(バイオセーフティーレベル3)に分類される。
ペスト菌は1894(明治27)年5月、内務省からペスト病調査のため香港に派遣された北里柴三郎によって発見された。
宿主はネズミ、犬、猫などの動物で、ノミにより媒介される。肺ペストは飛沫感染する。
