蛋白質の一次構造(アミノ酸配列)のうち、一方の端部、アミノ基側のこと。
まずアミノ酸というのは、一つの炭素原子を中心に、アミノ基(-NH2)、カルボキシル基(-COOH)、水素原子、側鎖が結合したものといえる。このアミノ酸が連結するに際しては、一方のアミノ酸のN末端(アミノ基)のH一つと、もう一方のC末端(カルボキシル基)のOHが取れ、結果脱水縮合してペプチド結合を形成するのである。
さて、このうちN末端のNという名は、アミノ基が-NH2であり、基の接合部分が窒素(N)であることから命名されている。