SARS-CoV-2 系統 B.1.617

読み：さーず・ころなういるす・つー・けいとう・びー・いち・ろっぴゃくじゅうなな
外語：SARS-CoV-2 lineage B.1.617

品詞：名詞

SARS-CoV-2(武漢肺炎ウイルス感染症の病原体)のうち、インドで最初に発見された変異株のうち代表的な系統。

概要

これを著している時点で、3種類のサブグループに分けられており、またそれぞれに多数の変異株が見つかっている。

1と2は感染が広がったが、3は発見後は殆ど確認されておらず、感染・伝搬性が低かったとみられる。

変異とサブグループの対応は次の通りである。

3種類の各系統の、それぞれのスパイク蛋白質の主な変異(60%以上の配列に見られる変異)は次の通りである。

インドでは当初はB.1.1.7(WHO名アルファ株)とB.1.617.1(WHO名カッパ株)が流行していたが、2021(令和3)年4月頃からこのB.1.617.2が増加している。

L452Rはインド型変異株に特徴的に見られる変異である。

L452Rの名称は、ウイルスが細胞に侵入する際に使う「スパイク蛋白質」を構成しているアミノ酸配列の452番目が、元々のL(ロイシン)からR(アルギニン)に置換されたことを表わす(以下同)。

それまで流行していたB.1.1.7(イギリス型変異株)と比して感染力が強まり、更にワクチンの効果を弱める可能性も指摘されている。

インド型変異株のうち系統 B.1.617.2(WHO名デルタ株)に生じた新たな変異がK417N変異である。系統 B.1.617.2.1 と呼ばれる。

これは、スパイク蛋白質417番目のアミノ酸がK(リシン)からN(アスパラギン)に置換されたものである。WHOは、これをデルタ・プラスなどと呼んでいる。

E484Kは、B.1.316(カナダ系統株)、B.1.1.4(イギリス系統株)などで確認されている変異で、「免疫逃避型変異」などとされており、中和抗体の効果を減弱する可能性が懸念されている。

インド型変異株はL452R変異が感染力を強め免疫を回避することが特徴となっていたが、2021(令和3)年7月、インド型変異株でL452R変異に加えてこのE484K変異を持った変異株が確認されたと発表されている。ワクチンの効果を更に弱める可能性がある。