真核生物

• ドメイン: 真核生物 Eukaryota

五界説や六界説では、真核生物は次の4界に分けられていた。

• 動物界 Animalia
• 植物界 Plantae
• 菌界 Fungi
• 原生生物界 Protoctista

現在では、これら「界」が同じ階層には無いことが分かっている。

そこで、界による分類を廃したり、その説を汲みながらも従来の界に当てはめたりなどし、様々な階層分類が模索されている(一覧後述)。

原核生物と比較して高等生物であると言われる。

真核生物は原核生物と比べて大きな細胞をもち、細胞内に様々な器官を持っている。また抵抗力なども備わっていて、長く生きることができるが、代わりに細胞分裂に要する時間は長く、機動力には欠ける。

界・門・綱までの階層構造については、現時点では未完成と言える状況である。

以下は分子系統解析などによる様々な学説を統合したもの。確定した分類ではなく、今後も様々な説により、変化していくと見込まれる。

なお、オピストコンタ上界(Opisthokonta)には、動物界(Animalia)に対してコアノゾア(Choanozoa)という分類法があるが、範囲が定かでない。Animalia以外とする場合と、AnimaliaとFungi以外とする場合、などがある。

• ユニコンタ Unikonta
  • オピストコンタ上界 Opisthokonta
    • Holomycota
      • 菌界 Fungi
        • ディカリア亜界 Dikarya
          • 子嚢菌門 Ascomycota
          • 担子菌門 Basidiomycota
        • (その他)
      • Nucleariid
        • ヌクレアリア目 Nucleariida
      • (所属不明)
        • Rozellida
    • ホロゾア Holozoa
      • メソミセトゾア Mesomycetozoa
        • メソミセトゾア綱 Mesomycetozoea
          • [目] Dermocystida
          • [目] Ichthyophonida
          • ? [目] Eccrinales
          • ? Amoebidiales
          • [綱] Corallochytrea
            • [属] Corallochytrium
      • フィロゾア Filozoa
        • フィラステレア綱 Filasterea
        • 襟鞭毛虫綱 Choanoflagellatea
        • 動物界 Animalia
          • 側生動物亜界 Parazoa
          • 真正後生動物亜界 Eumetazoa
  • アメーバ動物上界 Amoebozoa
    • アメーバ界 Amoebobiota アメーバ動物門 Amoebozoa (一界一門)
      • 葉状根足虫亜門(ロボサ亜門) Lobosa
        • ツブリネア綱 Tubulinea
          • ツブリニダ目 Tubulinida
          • レプトミクサ目 Leptomyxida
          • ナベカムリ目 Arcellinida
          • コプロミクサ目 Copromyxida
          • (分類不明)
            • Echinamoebidae
            • Trichosidae
        • フラベリネア綱 Flabellinea (旧称Discosea)
          • ダクティロポディダ目 Dactylopodida
          • ヴァンネラ目 Vannellida
          • ヒマティスメニダ目 Himatismenida
      • コノーサ亜門 Conosa
        • アーケアメーバ下門 Archamoebae
          • アーケアメーバ綱 Archamoebea
            • ペロミクサ目 Pelobiontida
            • マスティグアメーバ目 Mastigamoebida
        • 動菌下門 Mycetozoa
          • プロトステリウム綱 Protosteliomycetes
            • プロトステリウム目 Protosteliales
          • タマホコリカビ綱 Dictyosteliomycetes
            • タマホコリカビ目 Dictyosteliales
          • 変形菌綱 Myxomycetes
            • ハリホコリ目 Echinosteliales
            • コホコリ目 Liceales
            • ケホコリ目 Trichiales
            • モジホコリ目 Physarales
            • ムラサキホコリ目 Stemonitales
          • (所属不明)
            • エキノステリオプシス目 Echinosteliopsidales
        • (所属不明)
          • ヴァリポディダ目 Varipodida
          • ホロマスティギダ目 Holomastigida
          • ファランステリウム目 Phalansteriida
      • プロトアメーバ亜門 Protamoebae
        • ブレヴィアータ Breviatea
        • 雑多綱 Variosea
      • (所属不明)
        • アカントポディダ目 Acanthopodida
        • デルモアメーバ目 Dermamoebida
        • トリコシダ目 Trichosida
• バイコンタ上界 Bikonta
  • リザリア界 Rhizaria
    • アメーバ鞭毛虫門(ケルコゾア門) Cercozoa
      • クロララクニオン藻綱 Chlorarachniophyceae
        • クロララクニオン目 Chlorarachniales
      • グラノフィロセア綱 Granofilosea
        • ロイコディクティオン目 Leucodictyida
        • リムノフィラ目 Limnofilida
        • クリプトフィリダ目 Cryptofilida
        • 有殻太陽虫目 Desmothoracida
        • ヘリオモナディダ目 Heliomonadida
        • ギムノスファエラ目 Gymnosphaerida
      • サルコモナデア綱 Sarcomonadea
        • ケルコモナス目 Cercomonadida
      • テコフィローセア綱 Thecofilosea
        • フェオダレア亜綱 Phaeodarea
          • フェオギムノセリダ目 Phaeogymnocellida
          • フェオシスチダ Phaeocystida
          • フェオスファエリダ目 Phaeosphaerida
          • フェオカルピダ目 Phaeocalpida
          • フェオグロミダ目 Phaeogromida
          • フェオコンキダ目 Phaeoconchida
          • フェオデンドリダ目 Phaeodendrida
        • (所属不明)
          • テクトフィロシダ目 Tectofilosida
          • クリオモナディダ目 Cryomonadida
          • エブリア目 Ebriida
          • ヘミマスティクス目 Hemimastigida
          • ヴェントリクレフティダ目 Ventricleftida
      • インブリカテア綱 Imbricatea
        • タウマトモナス目 Thaumatomonadida
        • ユーグリファ目 Euglyphida
        • スポンゴモナス目 Spongomonadida
        • マリモナディダ目 Marimonadida
      • メトロモナス綱 Metromonadea
        • メトロモナス目 Metromonadida
        • メトピオン目 Metopiida
      • (所属不明)
        • パンソモナディダ目 Pansomonadida
        • グリッソモナディダ目 Glissomonadida
        • トレムラ目 Tremulida
    • レタリア上門 Retaria
      • 有孔虫門 Foraminifera 有孔虫綱 Foraminifera
        • 無室目 Athalamida
        • アログロミア目 Allogromiida
        • アストロリザ目 Astrorhizida
        • リツオラ目 Lituolida
        • トロカムニナ目 Trochamminida
        • テクスツラリア目 Textulariida
        • ミリオリナ目 Miliolida
        • カルテリナ目 Carterinida
        • スピリリナ目 Spirillinida
        • ラゲナ目 Lagenida
        • ブリミナ目 Buliminida
        • ロタリア目 Rotaliida
        • グロビゲリナ目 Globigerinida
        • インヴォルティナ目 Involutinida
        • ロベルティナ目 Robertinida
        • シリコロクリナ目 Silicoloculinida
        • プサミナ目 Psamminida
        • スタノマ目 Stannomida
      • 放散虫門 Radiolaria
        • ポリシスチネア綱 Polycystinea
          • スプメラリア目 Spumellaria
          • ナッセラリア目 Nassellaria
        • アカンタリア綱 Acantharea
          • ホロアカンチダ目 Holacanthida
          • シンフィアカンチダ目 Symphyacanthida
          • カウノカンチダ目 Chaunacanthida
          • 放射棘虫目 Arthracanthida
        • (所属不明)
          • タクソポディダ目 Taxopodida
    • (所属不明)
      • フィトミクサ綱 Phytomyxea
        • ファゴミクサ目 Phagomyxida
        • ネコブカビ目 Plasmodiophorida
      • グロミア綱 Gromiidea
        • 有殻糸状根足虫目 Gromiida
      • アセトスポレア綱 Ascetosporea
        • 略胞子虫目 Haplosporida
        • パラミクサ目 Paramyxida
        • クラウストロスポリディウム目 Claustrosporida
        • パラディニウム目 Paradinida
      • (所属不明)
        • レティキュロシダ目 Reticulosida
        • アコンクリニダ目 Aconchulinida
        • シュードスポラ目 Pseudosporida
  • エクスカバータ界 Excavata
    • メタモナーダ門 Metamonada
    • ロウコゾア門 Loukozoa
    • ユーグレナ門 Euglenozoa
    • ペルコロモナス門 Percolozoa
  • アーケプラスチダ(界) Archaeplastida (植物界 Plantaeと同義)
    • 灰色植物門 Glaucophyta
    • 紅色植物門 Rhodophyta
    • 緑色植物亜界 Viridiplantae/Chloroplastida
      • 緑藻植物門 Chlorophyta
      • ストレプト植物門 Streptophyta
        • 有胚植物(亜界) Embryophyta (これが狭義の植物)
          • Polysporangiophytaクレード
            • 維管束植物 Tracheophyta
              • シダ植物
                • シダ植物門 Pteridophyta
                • ヒカゲノカズラ門 Lycopodiophyta
              • 種子植物 Spermatophyta
                • 裸子植物 Gymnospermae
                  • ソテツ門 Cycadophyta
                  • イチョウ門 Ginkgophyta
                  • マツ門 Pinophyta
                  • グネツム門 Gnetophyta
                • 被子植物門 Angiosperm
          • コケ植物 bryophytes
            • ツノゴケ植物門 Anthocerotophyta
            • 蘚植物門/マゴケ植物門 Bryophyta
            • 苔植物門 Hepatophyta/ゼニゴケ植物門 Marchantiophyta
      • 車軸藻植物門 Charophyta
        • 車軸藻綱 Charophyceae
  • クロムアルベオラータ Chromalveolata
  • (所属不明)
    • 太陽虫門 Heliozoa
    • ハプト植物門 Haptophyta
    • テロネマ門 Telonemia
• (所属不明)
  • アプソゾア門 Apusozoa
    • テコモナデア綱 Thecomonadea
      • アプソモナス目 Apusomonadida
    • ヒロモナデア綱 Hilomonadea
      • アンキロモナス目 Ancyromonadida
      • ミクロヌクレアリア目 Micronucleariida
  • (所属不明)
    • ホロセア綱 Holosea
      • ルッフィスファエラ目 Luffisphaerida
    • ディフィレイア綱 Diphyllatea
      • ディフィレイア目 Diphylleida
    • (所属不明)
      • コマティオン目 Commatiida
      • ディスコセリス目 Discocelida